本发明涉及水处理技术领域,尤其涉及一种工厂化循环水养殖排放水脱氮装置及其脱氮工艺,向工厂化循环水养殖排放水脱氮装置的筒体中装填填料,再加入活性污泥和养殖排放水,挂膜启动,形成生物膜;从养殖水进水管中注入养殖排放水并搅拌,启动热交换器、开启曝气头,加热至水温为25-30℃,水体pH值调节至7-8,保持水体溶氧为2-3mg/L,水体停留时间为2-4小时,然后关闭搅拌器和曝气头,水体静置0.5-1小时,经过脱氮的水体从养殖水出水管中排放出。本发明适于含大量氨氮、硝酸根的工厂化循环水养殖排放废水的脱氮处理,能够显著降低水体氨氮和硝酸根浓度,大幅度减小工厂化循环水养殖排放水对环境的污染。