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本发明提供一种基于分形理论和BP算法的鱼识别及疫苗注射方法，包括：获取鱼的彩色图像；对所述彩色图像进行预处理、图像分割获取目标图像；运用分形理论算法提取分割后各目标图像的特征值，得到综合特征向量组；用BP神经网络算法对所述综合特征向量组进行训练，在所述目标图像中识别出符合鱼特定部位组合要求的图像；符合要求的鱼进行疫苗注射。本发明采用分形理论算法为鱼身体部位表征提供了全新的方法，8个表征鱼的特征值更能反映鱼的身体部位信息便于区分。分形理论和BP算法结合有效识别出鱼头及背脊组合要求的图像，为鱼疫苗注射提供一个很好的识别方法，实现机器化识别，注射过程也采用自动化注射，减轻人工负担。