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本发明一种杂交鲟养殖系统，属于水产养殖领域。一种杂交鲟养殖系统，包括养殖池和潜流湿地池，所述潜流湿地池依次被格栅划分成湿地进水区、植物种植区和湿地出水区，在湿地进水区的水面上方设有过滤装置，在湿地进水区和湿地出水区的底部靠近格栅处分别设有抽污泵，所述抽污泵均通过水管与过滤装置相通，在湿地进水区和养殖池的一端之间连有排污管道，在湿地出水区和养殖池的另一端之间则连有净水管道，在净水管道位于湿地出水区内的一端部接有抽水泵。本发明利用机械设施实现固液分离，利用潜流湿地去除杂交鲟养殖过程中产生的溶解性氮、磷、钾、重金属等代谢废物，实现水资源循环利用；且养殖系统位于温棚内，一年四季都可进行杂交鲟养殖活动。