在智利国家渔业和水产养殖局发布报告披露智利鲑鱼养殖公司去年共使用了450 700千克的抗生素之后，非政府组织——海洋保护组织（Oceana）敦促智利政府制定出一整套“迅速改变现状的目标”，以大幅减少该国鲑鱼养殖业的抗生素使用量。Oceana强调，该报告有关智利鲑鱼养殖业在2013年抗生素使用量的数据，与他们获得的挪威鲑鱼养殖业在2013年抗生素使用量的数据相差悬殊。挪威鲑鱼养殖公司在2013年只使用了972千克的抗生素。Oceana执行总裁指出，一项产业需要使用450吨抗生素是不正常的，不能进行清洁化生产的公司是不能容忍的，对生态系统加以保护，也是其他可持续经济活动的基础。
目前，智利的50家鲑鱼养殖公司拒绝透露他们所使用的抗生素的数量和种类。而智利国家渔业和水产养殖局给出的原因是，透露这些信息会给这些公司带来商业竞争和商业生存上的风险。
专家指出，过度使用抗生素的主要影响是细菌耐药性。这会导致抗生素不仅针对鲑鱼还有人类在使用后的效力大打折扣。
根据Oceana的数据，从2007年到2011年，智利鲑鱼养殖业抗生素用量从385 000千克降到了206 000千克，但此下降趋势止于2012年，该年份的用量再次上升达到了337 000千克以上。
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