为促进地方海洋渔业发展，打开“粤海粮仓”新“蓝海”，湛江海关发挥职能优势，从海洋渔业种质资源培育、水海产品扩大出口及产业升级等方面给予支持。
湛江海关针对辖区企业参与“粤强种芯”工程的意向，主动派员对接，深入企业进行现场指导，制定针对性帮扶措施。湛江海关支持建设具有自主知识产权的种质资源良种场，从药物残留监控、动物疫病防控等方面对企业进行“体检”，提升企业自检自控能力，指导企业建立完善养殖管理、药物使用、等各项管理制度，完善质量管理体系。同时，湛江海关依托海关技术中心专业检测资源，加强检测技术能力建设，为企业提供快速、精确的检测服务。
湛江海关支持深海养殖户、渔业合作社、企业、村集体有机融入深海养殖产业，发展工厂化养殖和“深水网箱”远海养殖模式，推进现代化海洋牧场建设。
近年来，凭借着水海产品的天然优势，湛江水产预制菜产业迅猛发展。针对新趋势，湛江海关引导企业开发水产预制菜品，帮扶企业构建水产预制菜标准体系，支持地方打造特色湛字品牌，推动产业向精深加工、高附加值方向发展。
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