近日,依托“中国-东盟渔业资源保护与开发利用项目”建设的珠江水产研究所生物信息中心云计算平台完成初步建设及系统测试。生物信息云计算平台由珠江所育种室进行系统设计,信息中心负责运维管理,主要对内提供高性能信息计算处理服务、同时对外服务。平台的建设符合生命科学、基因组学、生物信息学等学科快速交叉融合发展的理念,填补了珠江所在生信领域的空缺。生信平台面向以生物信息分析为基础的科研人员提供可视化、易操作、高效率的分析计算服务。平台有利于聚焦前沿技术,建立灵活、开放的交流机制,育种室和信息中心将为所内科研人员和研究生提供生信分析培训,推进生信技术在所内的应用。
生信平台面向所科研业务与研发需求,初步建立了计算、存储硬件设施。部署开发了相关分析工具及流程等软件平台,整合必要的生物数据库,可为动植物基因组及比较基因组分析,重测序,群体分析,全基因组关联分析,转录组及表观组分析,经济性状相关基因数据分析提供技术支持。
生信平台采用高性能计算节点和存储的高效组合,实现快速稳定的测序数据分析及交付,具备大规模组学数据的分析和处理能力。随着珠江所科研业务持续增长,中心的高性能计算平台将会持续更新并扩容,保证安全的数据存储和高效的数据处理。目前生信平台分析应用和运维人员由计算机科学、生物信息学、基因组学等领域的专业人员组成,为所提供生物信息计算分析服务,同时与多个国内外机构开展科研合作。
平台坚持新模型、新算法的开发使用,为生物学家提供更精确的分析工具,发现并快速解决生物信息学最前沿的问题。今后,平台将在CRISPR sgRNA设计、机器学习人工智能和数据挖掘等领域逐步搭建成熟的分析平台,并在此基础上展开以数据驱动的生物信息学和分子模块育种的创新研究,为相关领域的研究提供高效的生物信息资源和技术服务。