日前，国家海洋局第三海洋研究所联合浙江大学、深圳华大基因及中国海洋大学等单位，共同完成了我国重要海水经济鱼种大黄鱼全基因组测序，并绘制出大黄鱼基因组精细图谱。该研究成果近期在线发表于《美国公共科学图书馆·遗传学》（PLoS Genetics）上。
据了解，大黄鱼是目前我国海水网箱养殖单产量最高的鱼种，相关产业链年产值达100亿元。但近年来，大黄鱼种质退化、抗逆性差、病害频发等问题严重制约了其产业的持续健康发展。同时，大黄鱼具有的一些特殊生理及行为特性，如对环境胁迫敏感，尤其是对低氧和空气暴露等极为敏感等，这使得它可能作为研究环境胁迫应答机制的良好模型。为此，该研究团队采用细菌人工染色体与全基因组鸟枪法相结合的方式，对大黄鱼全基因组进行了测序，并获得了大黄鱼基因组精细图谱。
据悉，此次组装的大黄鱼基因组大小为679兆，基因区覆盖率达到98%以上，包含25401个蛋白编码基因。研究结果显示，大黄鱼不仅具有发达的先天性免疫系统，还具有相对完整的获得性免疫系统，其中大多数CD4+1型辅助性T细胞、CD4+2型辅助性T细胞和CD8+T细胞相关基因都存在于大黄鱼基因组中。该研究进一步揭示了神经—内分泌—免疫/代谢新的调控网络，在大黄鱼脑应答低氧胁迫中发挥着重要的作用，并发现皮肤粘液蛋白在大黄鱼应对空气暴露胁迫中的多重保护功能。这些研究结果为鱼类环境胁迫适应性的分子遗传机制提供了新认识。同时，大黄鱼全基因组数据也为培育性状优良的大黄鱼抗逆品种提供了有价值的基因资源，对于推动大黄鱼产业的持续发展具有重要意义。
（来源：中国海洋报）
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